当公司的老板发现员工在采购过程中吃回扣时，应根据公司内部规章制度以及国家相关法律法规进行处理。以下是一些建议的处理步骤：
一、调查核实
老板在得知员工可能存在吃回扣的情况后，应首先进行内部调查，以收集相关证据并确保事实清楚、证据确凿。调查内容应包括涉及的金额、人员、时间、交易细节等，以便全面了解问题的严重性。
二、依据公司规章制度处理
如果员工的行为确实违反了公司的规章制度，老板应根据公司规定对其进行相应的处罚。这些处罚可能包括警告、罚款、降职、解除劳动合同等。具体处罚措施应根据员工违规行为的严重性和公司规章制度的规定来确定。
三、法律追究
如果员工吃回扣的行为涉嫌违法，老板应选择向法律机构报案，由司法机关依法处理。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，员工可能面临挪用资金罪或非国家工作人员受贿罪的指控。一旦员工被依法追究刑事责任，公司可以依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定，解除与该员工的劳动合同，且无需支付经济补偿。
四、追回损失
在采取上述措施的同时，公司还应要求员工退还所有非法所得，即吃回扣所获得的全部收益。如果员工拒绝退还，公司有权通过法律途径追究其民事责任。
五、预防措施
为了避免类似事件的再次发生，公司应加强内部管理，完善相关规章制度，并定期对员工进行法律法规和职业道德的培训。同时，建立有效的监督机制，鼓励员工举报违法行为，确保公司利益不受损害。
六、公开透明
在处理此类事件时，公司应保持公开透明的态度，及时向员工通报处理结果，以维护公司的声誉和公信力。
综上所述，老板在发现员工吃回扣后，应依法依规进行处理，既要保护公司的利益和声誉，又要确保处理过程的公正性和合法性。
