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| 順位 | チーム | 勝点 | 試合数 | 得失差 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 清水エスパルス | 79 | 37 | 29 |
| 2 | 横浜ＦＣ | 75 | 37 | 33 |
| 3 | Ｖ・ファーレン長崎 | 72 | 37 | 32 |
| 4 | ファジアーノ岡山 | 64 | 37 | 19 |
| 5 | モンテディオ山形 | 63 | 37 | 15 |
| 6 | ジェフユナイテッド千葉 | 61 | 37 | 23 |
| 7 | ベガルタ仙台 | 61 | 37 | 5 |
| 8 | 徳島ヴォルティス | 54 | 37 | -2 |
| 9 | レノファ山口ＦＣ | 52 | 37 | -1 |
| 10 | いわきＦＣ | 51 | 37 | 9 |
| 11 | ブラウブリッツ秋田 | 51 | 37 | 0 |
| 12 | ロアッソ熊本 | 46 | 37 | -8 |
| 13 | 藤枝ＭＹＦＣ | 46 | 37 | -18 |
| 14 | 水戸ホーリーホック | 44 | 37 | -10 |
| 15 | 大分トリニータ | 43 | 37 | -13 |
| 16 | ヴァンフォーレ甲府 | 42 | 37 | -5 |
| 17 | 愛媛ＦＣ | 40 | 37 | -25 |
| 18 | 栃木ＳＣ | 33 | 37 | -24 |
| 19 | 鹿児島ユナイテッドＦＣ | 29 | 37 | -24 |
| 20 | ザスパ群馬 | 18 | 37 | -35 |
