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Molekulare Bioinformatik — Informationsfusion zur Genregulation

  • Conference paper
Informatik’99

Part of the book series: Informatik aktuell ((INFORMAT))

  • 86 Accesses

Zusammenfassung

Die Methoden der Bioinformatik haben zum Ziel unbekannte, große genomische Datenmengen auf ihre Funktion hin zu analysieren. Da dies unter Nutzung bekannter genomischer Datenmengen geschieht, können Methoden der Bioinformatik im weiteren Sinne als algorithmische Fusion verschiedener Informationsquellen verstanden werden. Beispielhaft wird unter dieser Sichtweise ein neues Verfahren vorgestellt, das Genschaltersequenzen in DNA identifiziert, ohne vorher eine Modellrepräsentation dieser zu bilden. Statt dessen werden hochspezifische Modelle der Genschaltersequenzen erst in Zusammenhang mit der zu analysierenden Sequenz gebildet. Das vorgestellte Verfahren ist das derzeit einzige, das Modelle von Genschaltersequenzen selbständig und anwendungsbezogen aus entsprechenden Informationsquellen erzeugt und somit die Vorhersagemethode als Prozeß der Informationsfusion begreift. Das Verfahren wurde implementiert und ist über obige WWW-Adresse als AliBaba2 verfügbar.1

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Literatur

  1. Heinemeyer, T., et al., Databases on transcriptional regulation: TRANSFAC, TRRD and COMPEL. Nucleic Acids Res., 1998. 26: p. 362–367.

    Article  Google Scholar 

  2. Quandt, K., et al., Matlnd and Matinspector: new fast and versatile tools for detection of consensus matches in nucleotide sequence data. Nucleic Acids Res., 1995. 23: p. 4878–4884.

    Article  Google Scholar 

  3. Chen, Q.K., G.Z. Hetz, and G.D. Stormo, Matrix-Search 1.0: A computer program that scans DNA sequences for transcriptional elements using a database of weight matrices. Comput. Applic. Biosci., 1995. 11: p. 563–566.

    Google Scholar 

  4. Akiyama, Y., TFSEARCH: Searching Transcription Factor Binding Sites. 1995.

    Google Scholar 

  5. Schug, J. and G.C. Overton, TESS: Transcription Element Search Software on the WWW,. 1997, Computational Biology and Informatics Laboratory School of Medicine University of Pennsylvania.

    Google Scholar 

  6. Shannon, C.E., A mathematical theory of communicatin. Bell Syst. Tech., 1948. 27: p. 379–423 and 623–656.

    Google Scholar 

  7. Berg, O.G. and P.H. von Hippel, Selection of DNA binding sites by regulatory proteins. Statistical-mechanical theory and application to operators and promoters. J.Mol.Biol., 1987. 193: p. 723–750.

    Article  Google Scholar 

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Grabe, N. (1999). Molekulare Bioinformatik — Informationsfusion zur Genregulation. In: Beiersdörfer, K., Engels, G., Schäfer, W. (eds) Informatik’99. Informatik aktuell. Springer, Berlin, Heidelberg. https://doi.org/10.1007/978-3-662-01069-3_27

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  • Publisher Name: Springer, Berlin, Heidelberg

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