はい、入学願書の受験資格欄には、現在通っている大学名を記入するのが適切です。 転入学の場合、出身校は現在在籍している大学となります。短期大学側も、あなたがこれまで大学教育を受けてきたことを確認するために、現在の大学名と在籍期間を記載することを求めています。 ただし、出願要項などで指定がある場合は、それに従う必要があります。疑問点があれば、出願先の短期大学の入試担当窓口に確認するのが賢明でしょう。