本人の収入を記載するのは基礎控除申告です。 非課税交通費は除いて良いが、あくまで本人の合計所得金額の見積額が900万円（給与収入だけなら1095万円）以下なら区分はAで「基礎控除の額」は48万円なので、おおよその金額で支障ないです。 また、会社は貴方の所得は把握できているので、「給与所得以外の所得の合計額」を確認したいだけです。