おそらく、紙の戸籍からコンピューターデータの戸籍へと「改製」された時点で変更されたのでしょう。 まずは、本籍地の役所で「改製原戸籍」（コンピューター移記前のもの）を取得してください。 その改製原戸籍とコンピューターの戸籍とを「戸籍係」にて提示して、なぜ変わったのかを聞いてみるといいでしょう。 紙の戸籍の文字が「戸籍に使用できる文字」であった場合は、紙の戸籍の文字に更正できる可能性があります。 その文字が、「正字」ではなく、いわゆる「誤字俗字」であり、法務省が定める「戸籍統一文字」にない場合は、改製作業の際に「正字」に変えられた可能性があります。 正確なことは、実際に処理をした本籍のある役所でしかわかりませんので、そちらで確認するしかないでしょう。