先にも回答しておられますが、藤村は長野県出身です。 長野と言えば昔から林檎の有名な産地であったので、林檎の樹がある風景というのは藤村にとっては自然だったのでしょう。 それと、もう一つ。 藤村は明治学院普通部本科で学んでいます。 明治学院といえば、キリスト教。 もちろん藤村自身も洗礼を受けています。 キリスト教と林檎のつながりは深く、たとえばアダムとイヴが食べた実が林檎であるという話は有名ですね。 （もっともこれは俗説で、正式にその実が何であるのかははっきりとしていませんが。） キリスト教徒であった藤村にとって、林檎は神聖なものであったと思います。 その神秘的な美しさが、「初恋」のイメージに合致していたのではないでしょうか。