まず、年末調整はその会社における給与に関する所得税の申告と納税を会社がやってくれる制度です。本業先でしかできません。
所得税というのは、その1年間の全部の所得に対してかかってきます。しかし現状は、本業先は本業先の給与を元に源泉徴収され年末調整で確定している状況であり、副業先は多分毎月源泉徴収されているだけの状況かと思います。
副業をしている場合、それらの所得を合算した本当の所得額と、それに対する所得税額を確定させ、源泉徴収されていた(つまり納税済みの)所得税額と比較し、足りなければ追加納税、多く払っていれば還付を受けるという流れになります。
なので副業先ではそもそも年末調整はできません。
源泉徴収票は発行してもらえるはずですので、もう一度もらえるようお願いしてください。年末調整ではなく、源泉徴収票です。
貰えないような個人経営の泡沫会社で働いていたなら、給与明細の束を持って確定申告することもできます。源泉徴収すらされていないなら、給与の合計額が所得になるんでそれを計算しておきます。
15万程度なら確定申告は不要ですが、住民税の申告は必要です。けど、確定申告の方が楽な気もしますけどね。源泉徴収票がもらえて源泉徴収額もわかったら、申告のシミュレーションをしてみるのもいいかもしれません。
・年末調整は本業先だけ
・源泉徴収票は本業先、副業先それぞれでもらえるはず
・両方の所得を合わせて確定申告を行う
・20万以下の場合は確定申告せずに住民税申告だけでもよい
こんな感じですかね。