恐らくは、たまたまその店舗で売り切れている可能性が高いかと思われます。 質問者様が挙げている店(おそらくサイゼリア？)を例としますと、使用頻度の高い普通のパスタなどはほぼ毎日入荷しているとは思われますが、使用頻度が比較的高くないショートパスタなどは数日に1回程度の入荷になることも多いです。 また、その割り当てに関しても以前の使用実績に基づいて決められることが多いため、普段利用の少ない店で突然大量の消費があると、直ぐに売り切れが生じるといったこともそこそこあるとは思います。