確定申告 ＝「所得税の確定申告」 ＝「所得税の確定申告書」の提出 は、「確定申告書の提出以前の事象 （＝年末調整やワンストップ特例のふるさと納税等）」を全否定して 「私のxx年の所得税の計算はこの申告書の内容です」 という意思表示です。 確定申告書に記入しなかったことは、無かったことになります。 確定申告書にワンストップ特例のふるさと納税を記入しない。 ＝「ふるさと納税していません」という意思表示です。 申告者（＝あなた）が「ふるさと納税していません」と 報告しているのですから次年度の住民税の計算でふるさと納税はなかったこととして処理されます。 ＞ワンストップ特例申請が済んでいるものはどうなりますか？ 自動的にワンストップ特例が無効になります。