券売機では購入できません。 そもそもその使い方をするなら「新幹線eチケット」を用いれば良く、きっぷを買う方法での乗り方自体が間違っています。 すべてをSuicaで完結させるか、すべてをきっぷで完結させるか、そのどちらかにすると考えたほうがいいです。 なお上野までの精算が伴う場合、Suicaとの併用や新幹線eチケットの利用は「損をする」場合があります。事前に確認して行動してください。