何の問題もありません。 そもそも不動産取引の多くは「仲介」ですから、買主は仲介業者に仲介手数料を支払うのが普通です。 たまに売主が宅建業者で「直売」して「仲介手数料不要！」と広告しているケースも見られますが、その取引が「仲介」ではないから仲介手数料が取れないと言うだけです。 法律的な話であれば、A社とB社が同族であったとしてもそこに利益相反は無く、A社がB社に仲介を依頼しているだけで、違法でも何でもありません。