この写真では虫種の判定はできません。 大きさから考えれば小バエ類の他にユスリカ類とか、アブラムシ類・チャタテムシ類・小型のハチ類など色々と考えられます。 どの虫であっても「飲みかけのコーヒーに止まって死ぬことなく泳いでいる」のではなく、コーヒーの中に落ちてもがいているのです。 珈琲には殺虫成分 (カフェイン等) があるので、間もなく死んでしまったと思われます。 その後も何度も見かけるとか増えてきたりするのなら、虫種を調べて対策が必要ですが、ご質問以後は見られないということならたまたまの侵入と思われるので、特に対策の必要はないでしょう。