高専卒の編入経験者です。編入先は熊本大ではありませんでした。
質問文から察するに、今年編入試験に合格されたのでしょうか。編入試験の合格、本当におめでとうございます。後は高専生活をしっかりやり切るのみですね。
さて、ご質問の単位の件ですが、私の大学はシラバスに基づき一括で認定してもらいました。入学次にシラバスを大学の教務に提出し、単位認定を受けるという形になります。
以前SNSで画像を見たことがあるのですが、一部の大学では「高専のその科目で学んだことを記し、その学んだ内容が単位認定を受けたい科目にどのように該当するかを書面で記し、単位を認めてもらう」という方式の大学もあるようです。
どちらの場合でも、高専で質問者さんが受講した科目のシラバスは全て出せるようにしておいてください。印刷してまとめておくのでも良いと思います。シラバスを学年ごとに分けて用意しておくだけでだいぶ違います。(念のため、高専卒業時の成績証明書もあると良いでしょう。)
単位認定試験を実施している大学は聞いたことがありませんが、私も全ての大学を把握しているわけではありません。当然、熊本大学で行われているかもわかりません(質問者さんがどの学部に編入するのかもわからないので、調べようもないです...)。不安でしたら、編入予定の学部の教務に問い合わせしてみると良いと思います。
一応、熊本大工学部の編入試験募集要項を調べて、「合格者の入学後の履修相談」という欄をサラッと一読しましたが、試験を行うという明記はありませんでしたね。
何はともあれ、編入してからも勉強することはたくさんあります。頑張ってくださいね。