生物濾過をしたいなら、プロテインスキマーは邪魔です。 スキマーで除去されるのはバクテリアではなく、バクテリアの餌になる有機物です。 硝酸塩も基本的には除去されません。（ＮＯ３：ＰＯ４－Ｘなど使用していれば別ですが、そもそもバクテリアがいないと効果はないです） 立ち上げはバクテリアを増やしたいのでスキマーは邪魔になります。 エアレーションは要りません。 水槽内にしっかりとした水流を作れば酸素は十分供給されますし、そのような水流がないと、水槽内に淀みができ、水質の面でよろしくありません。 スキマーでエアレーション効果を期待するようなシステムではダメと言うことです。 魚メインの飼育の場合、スキマーがあれば飼育が楽になると言うものでもないので、しっかりとした生物濾過のできるフィルターを設置し、時間をかけて水作りをするのが一番確実です。 サンゴも一緒に飼育したいというなら、しっかり濾過が立ち上がったあとにスキマー設置で硝酸塩を低く押さえて、それからサンゴを入れればいいと思います。