米国けんきゅうにっき

学位取得後、研究者として米国へ。このさきどのようなことが待ち受けているのでしょうか？

最近の我が家の食卓～その１

　2月も終わってしまうその前に一つでもエントリをあげておこうと思う。最近のできごとといえば、3月下旬にUtahのソルトレイクシティで開催されるアメリカ化学会で発表することになったことと、あとこの夏に名古屋で開催される国際学会に出席することが決まったことだろう。論文の方はCalTechの偉い先生に草稿を見てもらいコメントをいただいた。結果として不慣れな計算をすることになった。趣味としてコンピュータをいじるのは好きだが、仕事に使うのはちょっととまどいを感じる、というかもう抵抗を感じてしまう。だって入力値を設定したらあとはコンピュータ任せ。内部ではどのよーな演算が行われているのかは、デベロッパー頼みというわけ。これがホントーに学問なのだろうかと思ってしまう。そもそも計算化学を主体としている同僚の仕事の姿勢を見ているとイライラするから、その影響も大なのだろう。

　そんなことも言ってられないので、開発者の論文を読んで少しでもアルゴリズムを理解しようとするわけだ。今回のはいわゆるDFT(Density Functional Theory)ではなくて、タンパク質同士のドッキング計算なので、タンパク質表面同士の評価となる。まあそれでも様々な理論があるので、この辺は学問らしい。プログラムの内容自体は別として、まあこの辺はあんまり抵抗はないね。いろいろと孫文を読み、とりあえずフリーで提供されているBiGGERアルゴリズムとDOCKアルゴリズムを利用して計算させている。とくに後者はUNIXベースなので、Windowsで走らせるにはUnixエミュレータ上でソースコードをリビルドしなければならない。まあそういった作業を週末に完了させた。

　閑話休題。

　しばらくはブログの更新が滞り気味になると思うので、しばらくはMポンの作ってくれた料理をアップすることにする。


牛肉丼	田舎そば	豚肉カレー

2009年02月22日 | 生活 | トラックバック(0)件 | コメント (0)件

| ホーム |

プロフィール

cooyou

Author:cooyou
はじめまして！2001年に日本を飛び出し米国へ。研究分野は化学でしたが、2005年のはじめに職場を東海岸から山の中へ移し、その際に研究分野も大きく変えました。そして2010年に結婚とグリーンカード取得。さらにさらに2011年夏に再び1800マイルを東に向かい、新天地、ミシガンに生活の場を移しました。2016年夏に仕事の都合でテネシーに引っ越しました。クルマ関係の仕事ですが、未だに合間を見ては投稿論文の準備をしています。まあ、せっかくの貴重（？）な人生なので、日々の出来事を残しておくことができれば幸いです。

（最近の報道でFC2の将来の運営に少し不安を覚えましたのでライブドラブログにミラーを設置しました。メインの更新はFC2でこれまで通りにやっていきますので、あちらはバックアップと考えてください。）

最近の記事

最近のコメント

カウンター: 以前からあるカウンターが機能してないので設置します。まあ閑古鳥が鳴いておりますブログですが...ゆっくりしていってね！

アルバム

ブログ内検索

カレンダー

01 | 2009/02 | 03
日	月	火	水	木	金	土
1	2	3	4	5	6	7
8	9	10	11	12	13	14
15	16	17	18	19	20	21
22	23	24	25	26	27	28

月別アーカイブ