有小伙伴问我：
飞哥，plink的命令在哪里输入？
同样的问题还有：
- 如何安装plink软件
- plink软件的图标是什么
- plink软件有没有快捷方式
- ……
你以为plink软件像word或者Excel一样？
或者你以为plink软件像Python或者R语言一样？
它只是一个软件，一个只能在命令行添加参数的软件，没有图形界面，没有快捷方式，不能用鼠标点击的软件。
现在我提供三种方法，来运行plink软件。
首先是下载软件：https://www.cog-genomics.org/plink/1.9/
下载到本地，解压即可。
比如windows系统，解压下如下：
第一种方法：直接调用
很多人都是先在windows键找到cmd，然后再进入相关文件夹，其实有个简单的方法：直接在文件夹路径中输入cmd回车：
上面黑黑的框，就是cmd的终端，在里面运行plink软件。
如果输入plink.exe，就会出现帮助文档：
将plink文件变为0-1-2的编码形式：、
>plink --file toy --recodeA --out a1
结果：
如果有自己的文件，可以按照这个方式，将plink.exe放到自己的文件夹中，然后按照这种方式执行命令即可。
2. 放到环境变量中
这是经典的一种方法，还记得配置java环境吗，就是加入到环境变量中。如果了解到Linux系统，它就像bin文件夹一样。它的好处是可以在其它文件夹中直接调用，就像你可以在任何文件夹中新建excel一样。
首先，复制这个路径：
然后，打开我的电脑，右键–属性–高级系统设置
直接在上面的2中双击也是比较简单的：点击新建，然后粘贴进去plink.exe的路径即可。
测试：
随便进入一个路径，在目录下键入cmd，进入终端：
键入plink，就会出现帮助文档：
然后输入命令即可。
3. 使用git和bin模仿Linux系统
第三种，也是最简单的一种，安装git软件，然后右键打开git的终端：
然后运行下面命令，将plink.exe放到bin文件夹下：
mkdir ~/bin/; cp plink.exe ~/bin/
键入plink，就可以看到帮助文档，说明已经搞定了。
测试一下：
plink --file toy --recodeA --out a1
结果：
所以，你知道GCTA在windows是如何运行的吧？有三种方法……
