1. NTFS5.0可以支持的分区(如果采用动态磁盘则称为卷)大小可以达到2TB。而Win2000中的FAT32支持分区的大小最大为32GB。
2.NTFS5.0是一个可恢复的文件系统。在NTFS5.0分区上用户很少需要运行磁盘修复程序。NTFS通过使用标准的事物处理日志和恢复技术来保证分区的一致性。发生系统失败事件时，NTFS使用日志文件和检查点信息自动恢复文件系统的一致性。
3.NTFS5.0支持对分区、文件夹和文件的压缩。任何基于Windows的应用程序对NTFS分区上的压缩文件进行读写时不需要事先由其他程序进行解压缩，当对文件进行读取时,文件将自动进行解压缩；文件关闭或保存时会自动对文件进行压缩。
4. NTFS5.0采用了更小的簇,可以更有效率地管理磁盘空间。在Win 2000的FAT32文件系统的情况下,分区大小在2GB～8GB时簇的大小为4KB；分区大小在8GB～16GB时簇的大小为8KB；分区大小在16GB～32GB时,簇的大小则达到了16KB。而Win 2000的NTFS文件系统，当分区的大小在2GB以下时,簇的大小都比相应的FAT32簇小;当分区的大小在2GB以上时(2GB～2TB),簇的大小都为4KB。相比之下，NTFS可以比FAT32更有效地管理磁盘空间，最大限度地避免了磁盘空间的浪费。
5.在NTFS5.0分区上,可以为共享资源、文件夹以及文件设置访问许可权限。许可的设置包括两方面的内容：一是允许哪些组或用户对文件夹、文件和共享资源进行访问；二是获得访问许可的组或用户可以进行什么级别的访问。访问许可权限的设置不但适用于本地计算机的用户,同样也应用于通过网络的共享文件夹对文件进行访问的网络用户。另外,在采用NTFS格式的Win2000中,应用审核策略可以对文件夹、文件以及活动目录对象进行审核，审核结果记录在安全日志中，通过安全日志就可以查看哪些组或用户对文件夹、文件或活动目录对象进行了什么级别的操作，从而发现系统可能面临的非法访问,通过采取相应的措施，将这种安全隐患减到最低。甚至可能为每一个文件加密。可能有人会说在NT4.0中对用户设置许可就能实现这个功能。Ntfs5.0的加密文件系统其实不是一种文件系统，而是NTFS中的一个新的特性。它用一个随机产生的密钥把一个文件加密，只有文件的所有者和管理员掌握解密的密钥，其它人即使能够登录到系统中，也没有办法读取它。但是在NT4.0中，文件本身是没有加密的，如果一个用户想要读取一个他没有访问权限的文件的话，他只要在硬盘上安装另一套NT就可以了。但是在NTFS5。0下，由于文件是加密存储的，用户即使安装另外一套Windows2000，他也没有办法得到解密的密钥，因此加密文件系统的安全性更高。
6.在Win2000的NTFS文件系统下可以进行磁盘配额管理。磁盘配额就是管理员可以为用户所能使用的磁盘空间进行配额限制，每一用户只能使用最大配额范围内的磁盘空间。设置磁盘配额后，可以对每一个用户的磁盘使用情况进行跟踪和控制，通过监测可以标识出超过配额报警阈值和配额限制的用户，从而采取相应的措施。磁盘配额管理功能的提供，使得管理员可以方便合理地为用户分配存储资源，避免由于磁盘空间使用的失控可能造成的系统崩溃，提高了系统的安全性。
7. NTFS5.0使用一个“变更”日志来跟踪记录文件所发生的变更。
8.NTFS5.0支持动态的分区，也就是可以在线地改变分区的大小，不用退出系统，也不用格式化和重新启动。此外，如果有一个分区包含重要的文件信息，您可以为这个分区动态地创建镜像分区，在这个过程中，用户可以照常地在这个分区中进行文件读写，不会感到有任何的异常。当今后不再需要这个镜像的时候，又可以把这个镜像在线地取消掉。
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