在Linux系统中，如果要修改Tomcat目录，通常可以按照以下步骤进行操作：

1. 首先，需要确保已经安装了Tomcat，并且知道当前Tomcat的安装目录。通常情况下，Tomcat会被安装在`/opt/tomcat`或者`/usr/local/tomcat`这样的目录下。

2. 接下来，创建一个新的目录，用于存放新的Tomcat文件。可以使用命令`mkdir /opt/new_tomcat`来创建新的目录。

3. 复制Tomcat目录中的所有文件到新的目录中。可以使用命令`cp -r /opt/tomcat/* /opt/new_tomcat`来完成这一步骤。

4. 修改Tomcat配置文件中的相关路径信息，使其指向新的Tomcat目录。可以使用文本编辑器打开`/opt/new_tomcat/conf/server.xml`文件，查找并替换所有包含旧Tomcat目录的路径为新Tomcat目录的路径。

5. 修改环境变量，确保系统能够正确找到新的Tomcat目录。可以将新的Tomcat目录添加到`PATH`环境变量中，使系统能够正确识别Tomcat命令。

6. 重新启动Tomcat服务，检查修改是否生效。可以使用`/opt/new_tomcat/bin/startup.sh`来启动新的Tomcat服务，然后在浏览器中输入`http://localhost:8080`来访问Tomcat管理界面，确保修改已生效。

通过以上步骤，就可以成功修改Tomcat目录，在系统中使用新的Tomcat文件。在实际操作过程中，需要谨慎操作，确保每一步的操作都正确无误，以避免出现意外情况导致系统异常。希望以上内容能够对需要修改Tomcat目录的Linux用户有所帮助。