往期和大家分享了那些年遇到的细胞分选的坑-样品制备篇(一),今天和大家分享分选后的流式分析篇。
流式作为一种强大的细胞分析和分选的技术诞生于1965年,迄今已经有55年的历史。一个年过半百的老技术,竟然历久弥新,说明其强大的生命力和不断的技术进步。
流式就是写上一本大部头的著作,也无法面面俱到,这也不是本文的目的。
本文主要说一些和细胞分选之后,细胞纯度分析鉴定的Tips,希望能够帮助到大家。
本人才疏学浅,也并非流式专业出身,如有疏漏在所难免,贻笑大方,就当博君一乐。
流式细胞术,当然离不开流式细胞仪。随着我国能够生产流式细胞仪,价格一下子亲民了许多。几十万到上百万的都可以找到相应的型号。
做为细胞分选后纯度分析的手段,最基本的型号也可以满足基本的需求。如果实验室预算有限,最好先搞清楚流式细胞仪配置,激光和支持的荧光素。
流式和磁分选的前提是一样的,都需要单细胞悬液。在上一期样本制备坑里面,提到有些1)比例极低的细胞最好还是先做一下流式确定比例;2)有些易于凝集的细胞上流式之前,最好过滤一下。
在做流式分析鉴定的时候有哪些常见的坑呢?
1 没有对照,因此没法更加客观的设门。常见的对照有:阴性对照,同型对照。
2 荧光之间的补偿:大部分的荧光素在设备上已经调好了补偿,通常情况下是可以直接调用的。但是当细胞比较特殊的时候,比如补偿都是用外周血调的,而直接来了一个癌症细胞系,整个细胞的大小,表面marker的数量,都完全不同,这个时候最好重新调整一下补偿。
3 和流式老师的沟通:流式很少有自己操作的,基本有专门的老师负责。这个时候和操作的老师沟通清楚实验的设计,所用的荧光素,有哪些对照,有哪些单染管,还是非常有必要的。
4 电压的调整:一个配置不能通吃所有的实验,无需言明。在有些阴阳界限模糊的时候,调高一点电压,阳性更加阳性,而阴性还是阴性,就会得到漂亮的图。
简单调整电压,纯度从26.9%变成98.9%,就是这么神奇!
5 设门:流式虽然发展了50年,但是还是需要人工设门,仍然存在一定的主观性。设门要根据自己的实验,有根据,能自圆其说就行。
6 流式结果的解读:只要对照都设置了,结果是可信的,那就相信结果好了。至于为何与文献不一致,为何与其他人的不一致,自然有其原因,是寻找原因还是质疑结果?That’s a Choice. 比如DC 细胞本身形状不规则,在FSC/SSC上就能展现出来。比如分成两个群,有弱阳强阳,这个也是常有的事情。
7 回收率的计算: 最让人哭笑不得的是根据文献的比例计算理论产量,用实际的结果作为分子,经常说得率太低,真是“窦娥冤/逗鹅冤”,生物样本个体差异极大,同一个体不同时间的差异也极大。建议分选前的样本也染一下,看一下本次实验的比例作为计算分母的依据,然后得率就会正常。每一步的离心操作,都会造成损失,把所有的损失都算到分选的头上,也是有点逗鹅冤。流式分析的时候,拿分选前的样本计数做流式。