特征提取(机器学习数据预处理)
特征提取与特征选择都是数据降维的技术,不过二者有着本质上的区别;特征选择能够保持数据的原始特征,最终得到的降维数据其实是原数据集的一个子集;而特征提取会通过数据转换或数据映射得到一个新的特征空间,尽管新的特征空间是在原特征基础上得来的,但是凭借人眼观察可能看不出新数据集与原始数据集之间的关联。
这里介绍2种常见的特征提取技术:
1)主成分分析(PCA)
2)线性判别分析(LDA)
1.主成分分析(PCA)
一种无监督的数据压缩,数据提取技术,通常用于提高计算效率,帮助降低”维度灾难“,尤其是当模型不适于正则化时。
PCA是一种线性转换技术,其目标是在高纬度数据中找到最大方差的方向,并将数据映射到不大于原始数据的新的子空间上。(所谓数据方差最大的方向即数据沿着该方向的分布最分散)
PCA算法的流程:
1)对原始d维数据集做标准化处理;
2)构造样本的协方差矩阵;
3)计算协方差矩阵的特征值和相应的特征向量;
4)选择前k个最大特征值对应的特征向量,其中$k\leq d$;
5)通过前k个特征向量构建映射矩阵W;
6)通过映射矩阵W将d维的原始数据转换为k维的特征子空间。
标准化处理之前的内容有,这里不再赘述;
1.1构造协方差矩阵
公式:
1.2 协方差特征值与特征向量计算
数学原理不在这里细说,代码实现见下面的小节。
1.3 特征值与特征向量的选取
选取那些包含信息最多的的特征向量组成子集,特征值的大小决定了特征向量的重要性,所以选择特征值大小靠前的k个特征值作为选中的特征值,其对应的特征变量作为构建映射矩阵的特征向量。
我们还可以绘制特征值的贡献率:
1.4 构建映射矩阵W
将选中的k个特征向量构成一个(d,k)维的矩阵W。
1.5程序实现
import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
df = pd.DataFrame([\
[1,2,3,4,5,6],\
[2,4,6,3,3,4],\
[3,6,10,4,7,7],\
[2,4,7,6,5,4],\
[4,7,13,7,3,2],\
[1,2,3,3,6,4]\
],columns=["A","B","C","D","E","F"])
#1.标准化
sc = StandardScaler()
sc.fit(df.values)
X_std = sc.transform(df.values)
#2.生成协方差矩阵
cov_mat = np.cov(X_std)
#3.协方差矩阵的特征值与特征向量
eigen_vals,eigen_vecs = np.linalg.eig(cov_mat)
#4.按照重要程度由高往低将特征变量排序
sort_list = np.argsort(eigen_vals)
#取前两个向量组成转换矩阵
w = np.column_stack((eigen_vecs[:,sort_list[0]],eigen_vecs[:,sort_list[1]]))
#5.取第一个数据进行转换
x_1= X_std[0].dot(w)
print(x_1)
结果如下:
scikit_learn.decomposition模块中的PCA类也可实现此功能,使用方式如下:
from sklearn.decomposition import PCA
pca = PCA(n_component=2)
X_train_pca = pca(X_train_std)
PCA类中的n_component用于指定需要降到的维数。
2.线性判别分析(LDA)
LDA的目标是发现可以最优化分类的特征子空间,是一种监督算法。
LDA的执行步骤是:
1)对d维的原数据集进行标准化处理;
2)对于每一类别,计算d维的均值向量;
3)构造类间的散布矩阵$S_{B}$以及类内的散布矩阵$S_{W}$;
4)计算$S_{W}^{-1}S_{B}$的特征值及对应的特征向量;
5)选取前k个特征值所对应的特征向量,构造一个$d\timesk$维的转换矩阵W,其中特征向量以列的形式排列;
6)使用转换矩阵W将样本映射到新的特征子空间上。
大致上与PCA很相似,这里只介绍与PCA中不同的部分。
2.1计算类内散布矩阵$S_{W}$
import pandas as pd
import numpy as np
df = pd.DataFrame([\
[1,2,3,4,5,"ONE"],\
[2,4,6,3,3,"TWO"],\
[2,4,7,6,5,"ONE"],\
[4,7,13,7,3,"TWO"],\
],columns=["A","B","C","D","E","class_label"])
#类别列表
label_list = np.unique(df["class_label"].values)
mean_by_label = {}
#通过类别的数值作为key保存该类别对应的数据的均值
for label in label_list:
mean_by_label[label] = np.mean(df[df["class_label"]==label].values[:,:-1],axis=0)
for key,value in mean_by_label.items():
print(key,value)
结果如下:
同样scikit-learn库中也实现了LDA类
from sklearn.lda import LDA
lda = LDA(n_componets=2)