Engle和Granger观察到了一个相当有趣的现象。尽管两个时间序列是非平稳的，但在某些情况下，两者的特定线性组合实际上是平稳的；也就是说，这两个序列在某种程度上是步调一致的。Engle和Granger创造了“协整”（cointegration)一词，并在一篇文章中提出了这一概念(参考文献Engle, Robert F. and C. W. Granger. “Co-integration and Error Correction: Representation, Estimation and Testing.” Econometrica 55, no. 2 (March 1987) 251–276.)。值得注意的是，这是他们2003年获得诺贝尔经济学奖的其中一个理念。
和
是两个非平稳的序列，存在特定的值
，使得序列
是平稳的，那么就说和是协整的。
协整的变化情况可以被误差修正（error correction)的这个概念所描述。误差修正背后的思想是，协整系统有一个长期均衡值；即两个时间序列的线性组合的长期平均值。如果与长期均值存在偏差，则一个或两个时间序列会自行调整以恢复长期均衡。认为误差修正和协整本质上是等价的定理称为Granger representation theorem。
用
表示时间序列
的白噪声过程。用
表示时间序列的白噪声过程。误差修正表示为：
式子的左侧是每个时间步长的时间序列增量。右侧是两个表达式的总和，即修正部分和白噪声部分。我们来看看修正部分
，其中
表示与长期均值的偏离（本例子中长期均值是0），表示协整系数（coefficient of cointegration）。
误差修正率（error correction rate），表示时间序列校正回长期均值的速度。以及表示两个独立的白噪声，它们都服从均值为0，方差为1的正态分布。其它参数
，
，
。注意，在误差修正这个种情况下，和
要设置成相反的符号。那时间序列以及时间序列
就根据这些参数生成。如下图为两个时间序列：
协整的两个时间序列 根据
，可以继续计算spread价差时序，如下两图，从价差时序的自相关函数可以看出，价差是一个平稳的时间序列。
价差
价差时序的自相关函数
另一种协整建模的方法是Stock and Watson方法，又称为共同趋势模型（commond trends model).这个模型把时间序列表示成两部分组成：平稳部分和非平稳部分。如果两个时间序列是协整的，那么协整线性组合将抵消非平稳部分，只留下平稳部分。
考虑一下两个时间序列：
其中
和
是随机游走，即非平稳部分。以及是平稳的部分。线性组合
是协整组合来的时间序列，这个序列是平稳的。我们有：
如果上式是平稳的，那么非平稳的部分是0，即
，也就是说一个时间序列的趋势部分是另一个时间序列趋势部分的倍。所以，对于两个时间序列，如果他们协整，那么他们的趋势是某种程度（倍数的关系）是相同的。
