在 Python 中实现最远距离法聚类
聚类是一种常用的数据分析技术,其中最远距离法(也称为“完全链接法”)是一种基于距离的聚类方法。在这篇文章中,我们将引导你理解和实现 Python 中的最远距离法聚类。
流程概述
在进行最远距离法聚类之前,我们需要对整个流程有一个清晰的认识。以下是实现该聚类的方法步骤:
步骤 | 描述 |
---|---|
1 | 导入必要的库 |
2 | 准备数据集 |
3 | 计算距离矩阵 |
4 | 进行聚类 |
5 | 可视化结果 |
接下来,我们将逐步详解每个步骤。
1. 导入必要的库
首先,我们需要导入处理数据和进行聚类所需的库。在 Python 中,我们常使用 numpy
、scipy
和 matplotlib
来处理数据和绘图。
# 导入 numpy 用于数据处理
import numpy as np
# 导入 scipy 的层次聚类方法
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage
# 导入 matplotlib 用于绘图
import matplotlib.pyplot as plt
注释:以上代码导入了进行聚类和绘图需要的库,
numpy
用于数值运算,scipy
提供了层次聚类的实现,而matplotlib
用于可视化。
2. 准备数据集
接着,我们需要准备数据集。在本示例中,我们将使用随机生成的数据进行说明。
# 生成随机数据,设置随机种子以使结果可重复
np.random.seed(42)
# 生成 10 个随机点,2 维
data = np.random.rand(10, 2)
注释:这里我们生成了 10 个 2 维的随机数据点,以便用于聚类分析。
np.random.seed(42)
确保每次运行代码都会生成相同的随机数。
3. 计算距离矩阵
我们需要计算数据点之间的距离矩阵,以便进行聚类。最远距离法是使用最大距离进行聚类。
# 计算距离矩阵
from scipy.spatial.distance import pdist, squareform
# 使用 pdist 计算成对距离,使用 "euclidean" 方法
distances = pdist(data, metric='euclidean')
# 将距离矩阵转换为方阵
distance_matrix = squareform(distances)
注释:
pdist
函数计算数据点之间的距离,并返回一个一维数组。随后,squareform
将此数组转换为方阵,以便于可视化和使用。
4. 进行聚类
聚类的核心步骤是使用 linkage
函数进行层次聚类,并指定距离计算方法。
# 使用 linkage 函数进行最远距离法聚类
Z = linkage(data, method='complete')
# 创建层次聚类的树状图
plt.figure(figsize=(10, 7))
dendrogram(Z)
plt.title("Dendrogram of Complete Linkage Clustering")
plt.xlabel("Sample index")
plt.ylabel("Distance")
plt.show()
注释:这里我们使用
linkage
函数来进行聚类,method='complete'
表示采用最远距离法。最后,通过dendrogram
函数绘制树状图(dendrogram),展示聚类结果。
5. 可视化结果
通过可视化聚类结果,我们可以更直观地理解数据的聚类情况。
# 绘制聚类结果
plt.scatter(data[:, 0], data[:, 1], c='blue', marker='o', label='Data Points')
plt.title("Data Points and Clustering Result")
plt.xlabel("X-axis")
plt.ylabel("Y-axis")
plt.legend()
plt.show()
注释:这段代码绘制了数据点在二维空间中的分布。通过可视化,我们可以更好地看出数据点的分布情况。
总结
在本篇文章中,我们介绍了实现最远距离法聚类的全过程,涵盖了从数据准备到可视化的每一个步骤。所有的代码都配有详细注释,帮助你理解每一行代码的作用。这样的聚类方法在数据分析、市场细分等多种应用场景中都非常有效。
希望你在实践中能够不断尝试,深入理解聚类算法的原理与应用,成为一名优秀的数据分析师!
journey
title 最远距离法聚类流程
section 导入必要的库
导入 numpy: 5: 直观
导入 scipy: 5: 直观
导入 matplotlib: 5: 直观
section 准备数据集
生成随机数据:5: 直观
section 计算距离矩阵
计算成对距离:5: 直观
section 进行聚类
使用 linkage 进行聚类:5: 直观
绘制树状图:5: 直观
section 可视化结果
绘制数据点:5: 直观
在未来的工作中,务必利用这些知识,在实际数据分析中不断实践和探索。