文章目录

  • 前言
  • 使用随机森林回归填补缺失值
  • 1.导入库
  • 2. 以波士顿数据集为例,导入完整的数据集并探索
  • 3.为完整数据集放入缺失值
  • 4. 使用0和均值来进行填补
  • 5. 使用随机森林填补缺失值
  • 6. 对填补好的数据进行建模及评分
  • 7. 用所得结果画出条形图
  • 总结



前言

我们从现实中收集的数据,几乎不可能是完美无缺的,往往都会有一些缺失值。面对缺失值,很多人选择的方式是直接将含有缺失值的样本删除,这是一种有效的方法,但是有时候填补缺失值会比直接丢弃样本效果更好,即便我们其实并不知道缺失值的真实样貌。在sklearn中,我们可以使用sklearn.impute.SimpleImputer来轻松地将均值,中值,或者其他最常用的数值填补到数据中,在这个案例中,我们将使用均值,0,和随机森林回归来填补缺失值,并验证四种状况下的拟合状况,找出对使用的数据集来说最佳的缺失值填补方法。


使用随机森林回归填补缺失值

1.导入库

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import load_boston
from sklearn.model_selection import cross_val_score
from sklearn.impute import SimpleImputer #轻松的将均值,中值,或者其他常用的数值填补到数据中
from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor #回归森林在ensemble模块下

2. 以波士顿数据集为例,导入完整的数据集并探索

datasets = load_boston()
x_full = datasets.data
y_full = datasets.target
n_samples = x_full.shape[0] #统计数据的行数
n_features = x_full.shape[1] #统计数据的特征数目

3.为完整数据集放入缺失值

我们现在采样了3289个数据,远远超过我们的样本量506,所以我们使用随机抽取的函数randint

rng = np.random.RandomState(0) #确定随机数种子
missing_rate = 0.5
n_missing_samples = int(np.floor(n_samples*n_features*missing_rate))#np.floor是向下取整,因为缺失值的几率可能为其他

missing_samples = rng.randint(0,n_samples,n_missing_samples) #随机生成在哪一行具有空值,可以重复,构成横坐标
missing_features =rng.randint(0,n_features,n_missing_samples)#随机生成在哪一列具有空值,可以重复,构成纵坐标

x_missing = x_full.copy()#复制,防止对原数据进行破坏
y_missing = y_full.copy()

x_missing[missing_samples,missing_features] = np.nan #将上方横坐标和纵坐标构成的坐标的位置设置为空值

#isnull()在numpy里没有,只有在DataFrame内才可以使用,随意需要转换成DataFrame
#转换成DataFrame是为了后续方便各种操作,numpy对矩阵的运算速度快到拯救人生,但是在索引等功能上却不如
#pandas来得好用
x_missing = pd.DataFrame(x_missing)

如果我们需要的数据量小于我们的样本量506,那我们可以采用np.random.choice来抽样,choice会随机抽取不重复的随机数,因此可以帮助我们让数据更加分散,确保数据不会集中在一些行中

#将missing_samples换成下面即可
missing_samples = rng.choice(dataset.data.shape[0],n_missing_samples,replace=False)

4. 使用0和均值来进行填补

#均值填补
imp_mean = SimpleImputer(missing_values=np.nan,strategy='mean') #实例化
x_missing_mean = imp_mean.fit_transform(x_missing) #进行填充
#0值填补
imp_0 = SimpleImputer(missing_values=np.nan,strategy='constant',fill_value=0)
x_missing_0 = imp_0.fit_transform(x_missing)

5. 使用随机森林填补缺失值

随机森林填补理解的例子

  • 任何回归都是从特征矩阵中学习,然后求解连续型标签y的过程,之所以能够实现这个过程,是因为回归算法认为,特征矩阵和标签之前存在着某种联系。实际上,标签和特征是可以相互转换的,比如说,在一个“用地区,环境,附近学校数量”预测“房价”的问题中,我们既可以用“地区”,“环境”,“附近学校数量”的数据来预测“房价”,也可以反过来,用“环境”,“附近学校数量”和“房价”来预测“地区”。

如果有多个特征具有缺失值

  • 遍历所有的特征,从缺失最少的开始进行填补因为填补缺失最少的特征所需要的准确信息最少)。填补一个特征时,先将其他特征的缺失值用0代替,每完成一次回归预测,就将预测值放到原本的特征矩阵中,再继续填补下一个特征。每一次填补完毕,有缺失值的特征会减少一个,所以每次循环后,需要用0来填补的特征就越来越少。当进行到最后一个特征时(这个特征应该是所有特征中缺失值最多的),已经没有任何的其他特征需要用0来进行填补了,而我们已经使用回归为其他特征填补了大量有效信息,可以用来填补缺失最多的特征。遍历所有的特征后,数据就完整,不再有缺失值了
x_missing_reg = x_missing.copy() 
#argsort可以将传进去的元素从小到大排列,提取其对应的index(索引)
#将x_missing_reg里面的每一个特征为空的数据加起来,查看每一列有多少为空值
sortindex = np.argsort(x_missing_reg.isnull().sum(axis=0).values) 

for i in sortindex:
    df = x_missing_reg.copy()
    #提取需要进行预测填补的那一列作为标签,不可以用columns==i,
    #因为标签需要的是一维数据,而columns==i所提取出来的是DataFrame类型,是一个二维数据
    #如果直接写i,fillc就是series
    fillc = df.loc[:,i]
    #将原本的标签作为特征,建立新的矩阵,通过concat来进行矩阵的拼接
    df = pd.concat([df.loc[:,df.columns!=i],pd.DataFrame(y_missing)],axis=1)
    #将新构建的矩阵为空的值用0来进行填充
    #生成的df_0是np.ndarray类型
    df_0 = SimpleImputer(missing_values=np.nan,strategy='constant',fill_value=0).fit_transform(df)
    
    #找出训练集和测试集
    Ytrain = fillc.loc[fillc.notnull()]
    Ytest = fillc.loc[fillc.isnull()]
    Xtrain = df_0[Ytrain.index,:]
    Xtest = df_0[Ytest.index,:]
    
    #回归森林来预测填补缺失值
    rfc = RandomForestRegressor(n_estimators=100)
    rfc = rfc.fit(Xtrain,Ytrain)
    Ypredict = rfc.predict(Xtest)
    
    #将x_missing_reg中的当前这列中的为空值填补成使用回归森林预测的值
    x_missing_reg.loc[x_missing_reg.loc[:,i].isnull(),i] = Ypredict

6. 对填补好的数据进行建模及评分

X = [x_full,x_missing_mean,x_missing_0,x_missing_reg]
mse = []
#使用交叉验证来查看不同填充缺失值方法的打分情况
for i in X:
    estimator = RandomForestRegressor(n_estimators=100,random_state=0)
    score = cross_val_score(estimator,i,y_full,cv=10,scoring='neg_mean_squared_error').mean()
    mse.append(score)
    
[*zip(['x_full','x_missing_mean','x_missing_0','x_missing_reg'],mse)]

随机森林回归 Python代码 随机森林回归实例_数据

7. 用所得结果画出条形图

x_labels = ['Full data','Zero Imputation','Mean Imputation','Regressor Imputation']
colors = ['r', 'g', 'b', 'orange']
plt.figure(figsize=(12, 6))
ax = plt.subplot(111)
for i in np.arange(len(mse)):
    ax.barh(i, mse[i],color=colors[i], alpha=0.6, align='center')
ax.set_title('Imputation Techniques with Boston Data')
ax.set_yticks(np.arange(len(mse)))
ax.set_xlabel('MSE')
ax.set_yticklabels(x_labels)
plt.show()

随机森林回归 Python代码 随机森林回归实例_随机森林回归 Python代码_02


总结

由上可以观察出回归森林容易过拟合,可以进行参数的添加
主要要掌握思想