1、BUILD
    BUILD目录是编译、安装脚本目录，绝大部分以compile-开头，其中的SETUP.sh脚本为C和C++编译器设置了优化选项。
2、client
    client目录包括常用命令和客户端工具代码，这些源代码文件中包括密码确认功能get_password.c、SSL连接可行性检查、MySQL客户端mysql.cc、mysqladmin工具和mysqladmin用于服务器的运作mysqladmin.c、显示数据库及其表和列的mysqlshow.c等。
3、storage
    MySQL的各类存储引擎代码都在该目录中，包括CVS存储引擎（cvs目录）、InnoDB存储引擎、Federate等。
    myisam和myisammrg目录包括了MyISAM存储引擎的代码，myisammrg目录的文件是对merge表支持，myisam是MyISAM存储引擎的主要目录，其中包括IO操作、磁盘文件处理、行处理、索引处理。    
4、mysys
    mysys代表MySQL system library，是MySQL的库函数文件。库函数是一些预先编译好的函数的集合，这些函数都是按照可再使用的原则编写的。它们通常由一组互相关联的用来完成某项常见的工作的函数构成，从本质上来说库是一种可执行的二进制形式，可以被操作系统载入内存执行。在mysys目录中，共有125个.c文件，且随着版本的演化和新功能的加入，库函数也在不断的增大。
    其中包括用于快速排序的mf_qsort.c、用于临时文件管理的mf_tempfile.c、定义在客户端编译时采用字符集类型的charset-def.c、字符集相关操作（字符集加载、初始化等）的charset.c。
    mysys是一个大杂烩，包含了各种各样的功能库文件，包括文件打开、数据读写、内存分配、OS/2系统特别优化、线程控制、权限控制、RaidTable、动态字符串处理、队列算法、网络传输协议、初始化函数、错误处理、平衡二叉树算法、符号连接处理、唯一临时文件名生成、hash函数、排序算法、压缩传输协议等。
5、sql
    sql目录出了包含mysqld.cc这一MySQL main函数所在的文件外，还包括了各类SQL语句的解析/实现、线程、查询解析与查询优化器、存储引擎接口。在storage下各存储引擎目录中，存在的是各类存储引擎的实现代码，而在sql/目录下存放的是处理接口handler。handler类中存在很多虚函数，需要其子类进行实现。
    如今在MySQL 5.1中，综合文件hadler.cc和handler.h处理了所有不同种类存储请求。各种SQL语句的执行代码也可以在sql目录中找到，这类文件常以sql开始对文件命名。MySQL将UNION和ROLLUP等操作看作内部函数。
6、vio
    VIO意指Virtual I/O，主要用来处理各种网络协议的IO。Virtual I/O使得各种模块的网络协议能够无缝的调用I/O功能。MySQL网络子系统将调用这里的方法。
7、regex
    regex为MySQL提供执行正则匹配函数REGEXP时的支持。
8、dbug
    使用with-debug参数编译的MySQL会显示dbug输出，代码中的所有.c和.cc文件均可调用这个库。