MySQL的数据库存储在硬盘上的具体位置是由MySQL的数据目录决定的。在安装MySQL时，可以指定数据目录的位置，也可以使用MySQL默认的数据目录。MySQL的数据目录通常位于操作系统的文件系统中的某个目录下，其中包含MySQL的各个数据库以及相关的数据文件。

在MySQL中，每个数据库都对应着一个文件夹，文件夹中包含着该数据库的所有数据文件。每个数据文件对应着数据库中的一个表或索引。这些数据文件包括了表结构、表数据、索引等信息，以及MySQL的系统信息。

具体来说，MySQL的数据文件包括：

  1. FRM文件：存储表结构信息，包括表名、字段名、数据类型、索引等信息。
  2. MYD文件：存储表数据信息，每个MYD文件对应一个表，文件名与表名相同。
  3. MYI文件：存储表索引信息，每个MYI文件对应一个表的索引，文件名与表名相同。
  4. IB_LOGFILE文件：用于存储事务日志信息。
  5. ibdata1文件：用于存储InnoDB存储引擎的数据和系统表空间。

MySQL在处理数据时，会将数据读取到内存中进行处理，然后再将处理后的数据写回到数据文件中。这样做的好处是可以提高数据的访问速度，同时也可以保证数据的持久化存储。

总之，MySQL的数据库存储在硬盘上的具体位置是由数据目录决定的，数据目录中包含了MySQL的各个数据库以及相关的数据文件，其中每个数据文件对应着数据库中的一个表或索引，数据文件包括了表结构、表数据、索引等信息，以及MySQL的系统信息。