比较两个numpy数组是否相等的最简单方法是什么(其中equality定义为:a=b iff,对于所有索引i:A[i] == B[i])?
简单地使用==给了我一个布尔数组:
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3>>> numpy.array([1,1,1]) == numpy.array([1,1,1])
array([ True, True, True], dtype=bool)
我是否必须用and这个数组的元素来确定数组是否相等,或者是否有更简单的比较方法?
1(A==B).all()
测试数组(a==b)的所有值是否为真。
编辑(来自dbaupp的回答和yoavram的评论)
应注意:
在特定情况下,此解决方案可能有一种奇怪的行为:如果A或B为空,而另一个包含单个元素,则返回True。出于某种原因,比较A==B返回一个空数组,因此all运算符返回True。
另一个风险是,如果A和B的形状不相同且不可广播,那么这种方法会产生错误。
总之,我认为我提出的解决方案是标准的,但是如果你对A和B的形状有疑问,或者只是想安全:使用一种专门的功能:
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3np.array_equal(A,B) # test if same shape, same elements values
np.array_equiv(A,B) # test if broadcastable shape, same elements values
np.allclose(A,B,...) # test if same shape, elements have close enough values
号
你几乎总是想要np.array_equal时间。如果A和B的长度不同,(A==B).all()将崩溃。从numpy 1.10开始,==在这种情况下会发出折旧警告。
你有一个很好的观点,但是如果我对形状有疑问的话,我通常更喜欢在值之前直接测试它。然后,错误明显出现在形状上,这些形状与具有不同值的形状具有完全不同的含义。但这可能取决于每个用例
另一个风险是如果数组包含NaN。在这种情况下,你会得到错误,因为南!=南
很好指出。然而,我认为这是合乎逻辑的,因为nan!=nan意味着array(nan)!=array(nan)。
我不理解这种行为:import numpy as npH = 1/np.sqrt(2)*np.array([[1, 1], [1, -1]]) #hadamard matrixnp.array_equal(H.dot(H.T.conj()), np.eye(len(H))) # checking if H is an unitary matrix or noth是一个单位矩阵,所以h x H.T.conj是一个单位矩阵。但np.array_equal返回错误
(A==B).all()解决方案非常简洁,但有一些内置功能可用于此任务。即array_equal、allclose和array_equiv。
(不过,一些对timeit的快速测试似乎表明,(A==B).all()方法是最快的,这有点奇怪,因为它必须分配一个全新的数组。)
你说得对,只是如果比较的数组中有一个是空的,那么用(A==B).all()会得到错误的答案。例如,试一试:(np.array([1])==np.array([])).all()给True,np.array_equal(np.array([1]), np.array([]))给False。
我也发现了这种性能差异。这很奇怪,因为如果你有两个完全不同的数组,那么(A==B).all()仍然比np.array_equal(a, b)快(它可以检查单个元素并退出)。
np.array_equal也与lists of arrays和dicts of arrays一起工作。这可能是性能降低的原因。
非常感谢函数allclose,这是我需要的数值计算。它比较了公差内向量的相等性。:)
让我们用下面的代码来度量性能。
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33import numpy as np
import time
exec_time0 = []
exec_time1 = []
exec_time2 = []
sizeOfArray = 5000
numOfIterations = 200
for i in xrange(numOfIterations):
A = np.random.randint(0,255,(sizeOfArray,sizeOfArray))
B = np.random.randint(0,255,(sizeOfArray,sizeOfArray))
a = time.clock()
res = (A==B).all()
b = time.clock()
exec_time0.append( b - a )
a = time.clock()
res = np.array_equal(A,B)
b = time.clock()
exec_time1.append( b - a )
a = time.clock()
res = np.array_equiv(A,B)
b = time.clock()
exec_time2.append( b - a )
print 'Method: (A==B).all(), ', np.mean(exec_time0)
print 'Method: np.array_equal(A,B),', np.mean(exec_time1)
print 'Method: np.array_equiv(A,B),', np.mean(exec_time2)
产量
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3Method: (A==B).all(), 0.03031857
Method: np.array_equal(A,B), 0.030025185
Method: np.array_equiv(A,B), 0.030141515
。
根据上面的结果,numpy方法似乎比==运算符和all()方法的组合更快,通过比较numpy方法,最快的方法似乎是numpy.array_equal方法。
您应该使用一个更大的数组大小,它至少需要一秒钟的编译时间来提高实验的准确性。
如果要检查两个数组是否具有相同的shape和elements,则应使用np.array_equal,因为这是文档中建议的方法。
Performance-wise don't expect that any equality check will beat another, as there is not much room to optimize comparing two elements. Just for the sake, i still did some tests.
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13import numpy as np
import timeit
A = np.zeros((300, 300, 3))
B = np.zeros((300, 300, 3))
C = np.ones((300, 300, 3))
timeit.timeit(stmt='(A==B).all()', setup='from __main__ import A, B', number=10**5)
timeit.timeit(stmt='np.array_equal(A, B)', setup='from __main__ import A, B, np', number=10**5)
timeit.timeit(stmt='np.array_equiv(A, B)', setup='from __main__ import A, B, np', number=10**5)
> 51.5094
> 52.555
> 52.761
差不多,没必要谈论速度。
(A==B).all()的行为与以下代码片段非常相似:
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4x = [1,2,3]
y = [1,2,3]
print all([x[i]==y[i] for i in range(len(x))])
> True
。