乐胖代购免代理版

欢迎

你的DNA都会玩摇滚了，你却还是个音痴

在KTV对朋友调侃道：“五音不全的你还非得做麦霸，哪儿来的自信！

生物信息

ide

html

可视化工具

原创 2023-07-27 12:33:09 96 阅读

本地安装UCSC基因组浏览器

UCSC基因组浏览器在大规模高通量数据的可视化和比较分析研究

生物信息

mysql

hg

apache

原创 2023-07-27 12:20:00 208 阅读

整合QC质控结果的利器——MultiQC

title: “MultiQC”author: “lld”date: “2018/11/26”output: html_d

multiqc

NGS

高通量测序

生物信息

官网

原创 2023-07-27 12:18:34 666 阅读

生物信息学数据库

生物信息学数据库分类概览Meta databases ac...

生物数据库

生信数据库

数据库

数据

Database

原创 2023-07-27 12:18:18 215 阅读

生信分析过程中这些常见文件（fastq/bed/gtf/sam/bam/wig）的格式以及查看方式你都知道吗？

生信分析过程中，为了得到分析结果，我们除了需要原始测试数

生物信息

高通量测序

数据格式

sed

数据可视化

原创 2023-07-27 12:10:26 2992 阅读

无需写代码的高颜值富集分析神器

今天给大家带来的是Cytoscape的插件——ClueG

GEO

TCGA

富集分析

网络图

数据集

原创 2023-07-26 15:25:46 145 阅读

是Excel的图，不！是R的图

原文章来源链接：httng, Data visualization, High Performance Computing ...)...

生物信息

R

折线图

饼图

数据

原创 2023-07-26 15:24:39 46 阅读

生物AI插图免费领取

人靠衣装，佛靠金装，科研成果靠图装。如今做科研不仅

插图

AI

论文

生物信息

学术论文

原创 2023-07-26 15:04:08 88 阅读

AnimalTFDB 3.0 | 动物转录因子注释和预测的综合资源库

转录因子（Transcription factor，TF）是一类能够以序列特异性实验方法（如...

搜索

数据库

ci

原创 2023-07-26 15:00:51 500 阅读

增强火山图，试一下？

Kevin Blighe 协和医学院苑晓梅

火山图

差异基因火山图

github

图例

自定义

原创 2023-07-26 14:59:39 85 阅读

NGS基础：测序原始数据下载

生物或医学中涉及高通量测序的论文，一般会将原始测序数据上传到公开的数据库，上传方

高通量数据下载

高通量数据上传

生物信息

NCBI

SRA

原创 2023-07-19 11:49:11 183 阅读

基因组浏览器使用 (EPGG)

基因组浏览器是高通量测序分析的一个重要的可视化工具。相比于最终提供的表格，基因组器可视化高通量测序数据和UCSC 基因组浏览器的安装使用。最近几...

EPGG

基因组浏览器

生物信息

高通量数据可视化

数据

原创 2023-07-19 11:49:04 568 阅读

DESeq2差异基因分析和批次效应移除

差异基因鉴定基因表达标准化不同样品的测序量会有差异，最简单的标准化方式是计算 counts

生物信息

差异基因分析

ci

几何平均

中位数

原创 2023-07-19 11:48:35 830 阅读

肿瘤化疗无效是对预先存在的突变的选择还是诱发新突变，Cell给你答案

三阴乳腺癌（TNBC）是乳腺癌的一种侵袭性亚型，常对化疗产生耐药性。而耐药性的

肿瘤治疗

基因突变

外显子组测序

DNA测序

转录组测序

原创 2023-07-19 11:48:23 43 阅读

GEO2R/GEOquery的结果可能是错的！！！

前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程（原理、代码和评述）)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医step) - Limma差异分析...

数据分析

数据

原始数据

原创 2023-07-19 09:57:28 171 阅读

network3D 交互式网络图和桑基图

在R中...

数据

Python

Math

原创 2023-05-07 23:06:12 251 阅读

高通量测序分析工具Bedtools使用介绍

合，其主要功能如下：bedtools: flexible tools for genome arithmetic and DNA sequence analysis.usage: bedtools <subcommand> [option...

NGS

高通量测序

bedtools

bed

相似性

原创 2023-05-07 23:06:01 1023 阅读

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（四）

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（一）Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（二）Hemberg-lab单细胞

单细胞转录组分析

数据

perl

github

原创 2023-05-07 23:03:08 165 阅读

Gut | 汤富酬研究组与付卫研究组合作揭示家族性腺瘤性息肉病的发病机制

结直肠癌在全球范围内是发病率第三、致死人数第四的恶性肿瘤(Beattie et al., 2005 ; Carey, 2017

ci

上传

外链

原创 2023-05-07 23:00:41 151 阅读

代码分析 | 单细胞转录组clustering详解

聚类可视化NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你

聚类

树状图

数据

原创 2023-05-07 22:58:26 282 阅读

代码分析 | 单细胞转录组数据整合详解

在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程（原理、代码和评述）)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Lim...

数据集

数据

加载

原创 2023-05-07 22:57:59 578 阅读

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（一）

整合版以网页和PDF格式发布于易生信平台。关于课程采用高通量测序技术获取单细胞水...

生物信息

单细胞

转录组

单细胞转录组分析

Docker

原创 2023-05-02 22:28:57 139 阅读

为什么GEO2R/GEOquery的结果可能是错的？

为什么GEO2R/GEOquery的结果可能是错的？在准备GEO/TCGA培训时，码这样获取非原始数据...

公共数据

GEO

GEO2R

GEOquery

数据

原创 2023-05-02 22:28:17 134 阅读

用R在地图上绘制网络图的三种方法

记之ggridges包 ggplot2学习笔记之图形排列网...

生物信息

可视话

连线

权重

扩展包

原创 2023-05-02 22:25:44 95 阅读

用了这么多年的PCA可视化竟然是错的！！！

本文启发于上周开的单细胞转录组课程，本次课程由资深单细胞算法研究者戴老师主讲

生物信息

R

主成分分析

测试数据

特征值

原创 2023-05-02 22:25:22 107 阅读

骨髓基质在正常和白血病个体中的细胞图谱|Cell最新（文末有彩蛋）

用单细胞RNA测序（scRNA-seq）来定义小鼠骨髓基质的细胞分类和由恶性肿瘤引起的基质变化。我们鉴定了17个表达不同造血调节基因的基质亚...

h5

数据分析

随机森林

原创 2023-05-02 22:24:40 303 阅读

赠你一只金色的眼 - 富集分析和表达数据可视化

GOplot包介绍GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说，该包将

生物信息

可视化

GOplot

数据

ci

原创 2023-05-02 22:24:05 185 阅读

富集分析和基因表达花样可视化

GOplot包介绍GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说，该包将表达数据

富集分析

基因表达

可视化

go

生物信息

原创 2023-05-02 22:23:42 249 阅读

七龙珠 |召唤一份单细胞数据库汇总

每次分析自己的单细胞数据后，都让我产生无限的遐想与yy，总感觉不对劲也说不上是哪里

生物信息

单细胞

数据

数据库

搜索

原创 2023-05-02 22:23:25 128 阅读

道友，来Rstudio里面看动画了

gganimate |让你的图动起来！这是ggplot中十分可爱的一个扩增包，目。view_*(...

r

数据

数据格式

github

原创 2023-05-02 22:23:02 47 阅读

官方博客	全部文章	热门标签	班级博客
了解我们	网站地图	意见反馈

鸿蒙开发者社区	51CTO学堂
51CTO	软考资讯

51CTO博客

wx643df9f1afa1d的博客

欢迎

你的DNA都会玩摇滚了，你却还是个音痴

本地安装UCSC基因组浏览器

整合QC质控结果的利器——MultiQC

生物信息学数据库

生信分析过程中这些常见文件（fastq/bed/gtf/sam/bam/wig）的格式以及查看方式你都知道吗？

无需写代码的高颜值富集分析神器

是Excel的图，不！是R的图

生物AI插图免费领取

AnimalTFDB 3.0 | 动物转录因子注释和预测的综合资源库

增强火山图，试一下？

NGS基础：测序原始数据下载

基因组浏览器使用 (EPGG)

DESeq2差异基因分析和批次效应移除

肿瘤化疗无效是对预先存在的突变的选择还是诱发新突变，Cell给你答案

GEO2R/GEOquery的结果可能是错的！！！

network3D 交互式网络图和桑基图

高通量测序分析工具Bedtools使用介绍

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（四）

Gut | 汤富酬研究组与付卫研究组合作揭示家族性腺瘤性息肉病的发病机制

代码分析 | 单细胞转录组clustering详解

代码分析 | 单细胞转录组数据整合详解

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（一）

为什么GEO2R/GEOquery的结果可能是错的？

用R在地图上绘制网络图的三种方法

用了这么多年的PCA可视化竟然是错的！！！

骨髓基质在正常和白血病个体中的细胞图谱|Cell最新（文末有彩蛋）

赠你一只金色的眼 - 富集分析和表达数据可视化

富集分析和基因表达花样可视化

七龙珠 |召唤一份单细胞数据库汇总

道友，来Rstudio里面看动画了