genesis2000标注脚本下载

目录

• 1. 下载安装包
• 2. 解压，安装，启动服务

• 2.1 解压安装包
• 2.2 切换路径
• 2.3 运行install.sh进行安装
• 2.4 运行standalone.py启动服务

• 3. 在浏览器登录

• 3.1 登录
• 3.2 导入数据，生成.ann文件
• 3.3 选择需要标注的文件
• 3.4 开始标注

• 4. 对标注的数据结构进行配置

• 4.1 实体添加
• 4.2 中文设置
• 4.3 设置颜色
• 4.4 设置关系

1. 下载安装包

下载地址：http://brat.nlplab.org/index.html

如图所示，点击download下载：

2. 解压，安装，启动服务

2.1 解压安装包

tar xzf brat-v1.3_Crunchy_Frog.tar.gz

2.2 切换路径

cd brat-v1.3_Crunchy_Frog

2.3 运行install.sh进行安装

./install.sh

2.4 运行standalone.py启动服务

python standalone.py

在standalone.py的第63、64行可以修改ip地址和端口号，如图所示：

3. 在浏览器登录

根据设置的地址和端口号，在浏览器登录，登录后如图所示：

3.1 登录

鼠标移动到如图所示右上角登录，不然无法进行标注。

3.2 导入数据，生成.ann文件

将数据放在brat-v1.3_Crunchy_Frog/data路径下，可以根据自己的项目新建文件夹，如test，在路径brat-v1.3_Crunchy_Frog/data/test放入需要进行标注的数据。
文件的格式是.txt的格式。
运行如下指令，生成文件夹下与.txt同名的.ann文件：

find 文件夹名称 -name '*.txt'|sed -e 's|\.txt|.ann|g'|xargs touch

注：必须要同时有.txt和.ann文件，才能进行标注。

3.3 选择需要标注的文件

在浏览器窗口中点击tab键，选择需要标注的文件进行标注，如图所示：

选择文件，点击OK。

3.4 开始标注

选择我们需要标注的内容，如图所示，选择系统性血管炎

选择之后，界面会弹出如下的标注界面，选择Disease对系统性血管炎进行标注：

标记完之后，点击OK，标记完成，如下图所示：

标记完成之后，将鼠标移至上方蓝色处，然后点击data：

之后会弹出如下界面，点击OK保存，标注完毕。标注后的内容会保存在.ann文件中。

4. 对标注的数据结构进行配置

4.1 实体添加

在brat-v1.3_Crunchy_Frog路径中，打开annotation.conf文件，添加我们需要的实体名称，如图所示，这里我们添加了Disease、Drug两个实体名称。

4.2 中文设置

（注：直接在annotation.conf里添加中文实体经常会报错）

这样，在标注的时候，就可以显示中文，如下图所示：

4.3 设置颜色

在路径brat-v1.3_Crunchy_Frog路径中，打开visual.conf，找到[drawing]，如图示设置颜色：

4.4 设置关系

在brat-v1.3_Crunchy_Frog路径中，打开annotation.conf文件，找到[relations]，设置实体之间的关系，下图45~48行表示：

xx疾病 有 xx症状

xx疾病 推荐使用 xx药物

xx疾病 属于 xx部门

xx疾病 做了 xx检查

设置完关系之后，可以在浏览器界面，对于两个标注后的部分，可以从一端拖动到另一端，实现关系的标注，如下图所示：

**结束。**标记完成后，记得保存（怎么保存见3.4节内容）。