R语言 oligo xps包_51CTO博客
R语言心得说:R语言之xlsx读写Excel数据感谢Adrian A. Drǎgulescu发布的xlsx包工具准备【基础】简单读取excel文件数据【基础】简单写入数据到excel文件【进阶】随心所欲读取excel中的各种信息【进阶】随心所欲将数据写入excel文件 感谢Adrian A. Drǎgulescu发布的xlsxxlsx提供了必要的工具来与Excel 2007进行交互。用户可
前言 最近想试一下捣腾一个 R 出来,故参考了一些教程。现在看到的最好的就是谢益辉大大之前写过的开发R程序之忍者篇,以及 Hadley 大神(ggplot2 devtools 等一系列的作者)的 教程。但是前者有一些过时,后者是全英文的,所以我这里记录一下比较简单的过程,给读者们一个参考思路。如果你有一些 R 程序,想塞到去一个自创的 R 中,那么这篇文章就可能是你想要的。为了方
转载 2023-09-02 15:12:54
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R 2.14.0版本以后,parallel包被作为核心包引入R,这个主要建立在 multicore 和 snow 的工作基础之上,包含了这两个大部分功能函数,以及集成了随机数发生器。实际上对于R来说,并行化可以在不同的层级上实现:比如,在最底层,现在的多核CPU可以实现一些基础的数值运算(比如整数和浮点算数); 高级一点的,一些扩展BLAS使用多线程并行处理向量和矩阵的操作,甚至有些R扩展
转载 2023-12-09 12:17:34
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数据挖掘主要分为4类,即预测、分类、聚类和关联,根据不同的挖掘目的选择相应的算法。R语言博大精深,吸纳了来自各方的挖掘算法,这些都是由统计学家或是算法研究人员提供,我们可以站在这些伟人的肩膀上实现算法的应用。下面对常用的数据挖掘做一个汇总:连续因变量的预测:statsstatsstatsrpartRWekaadabagadabagrandomForeste1071kernl
转载 2023-06-21 18:36:04
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另外再推荐一个在线绘制venn图的网站(除了广告较多都挺好的):https://www.meta-chart.com/venn具体包括下面三个: limma、venneuler、VennDiagram。总的来说,三个都有着各自的不足。下面会一一进行说明,这里先放上结论:综合方便程度以及函数的多样性而言,VennDiagram > venneuler > limma。limma首先针
1. vim 删除一列先使用ctrl + v,移动方向键,选择矩形区域,然后按 d 进行删除如果要在每一列前面加一个“{ ”------>修改列为特殊字符(ctrl + v选好后使用r替换成特殊字符),然后使用:%s替换命令如果要在每一列后面加一个“},” ------> 1. 修改最后一个字符为特殊;2. 使用命令“:%s /,\r/
转录组edgeR分析差异基因edgeR是一个研究重复计数数据差异表达的Bioconductor软件。一个过度离散的泊松模型被用于说明生物学可变性和技术可变性。经验贝叶斯方法被用于减轻跨转录本的过度离散程度,改进了推断的可靠性。该方法甚至能够用最小重复水平使用,只要至少一个表型或实验条件是重复的。该软件可能具有测序数据之外的其他应用,例如蛋白质组多肽计数数据。可用性:程序包在遵循LGPL许可证下可
R语言利用ALL数据集作柱状图和热图#下载数据 #BiocManager::install(“ALL”) #BiocManager::install(“Biobase”)#加载数据 library(“ALL”) library(“Biobase”)#载入数据集 data(“ALL”)#查看相关消息 ALL‘筛选数据子集,并且将数据存入case1内,条件一:BT列数据在前五行的集合内
转载 2023-08-09 20:55:45
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导读本文整理了R语言绘图中使用频率较高的程序,每个程序都附载相应的参考来源链接(链接里有实现绘图的脚本)和下载链接。另:茗创科技为大家提供免会员极速下载服务,需要相应程序的小伙伴可以私信茗创科技周翊工程师,微信号MCKJ-zhouyi或17373158786。gganimate:在R中绘制动态图gganimate在CRAN上可通过install.packages('gganimate')来安
2.3.6 导入 SPSS 数据 IBM SPSS数据集可以通过foreign中的函数read.spss()导入到R中,也可以使用Hmisc 中的spss.get()函数。函数spss.get()是对read.spss()的一个封装,它可以为你自动设 置后者的许多参数,让整个转换过程更加简单一致,最后得到数据分析人员所期望的结果。 首先,下载并安装Hmisc(foreign已被默认安装
Rglmnet是通过惩罚最大似然法拟合广义线性和类似模型的软件。1. 加载和数据#install.packages("glmnet", repos = "https://cran.us.r-project.org") library(glmnet) ls("package:glmnet") # x = matrix(rnorm(100 * 20), 100, 20)*10 # y = r
转载 2023-10-30 21:31:38
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目录引言1、数据构造2、筛选2.1 dplyr::filter基本语法:案例2.2 sqldf:sqldf关键字select、from、where、where3、排序3.1 dplyr::arrange3.2 sqldf:sqldf关键字:order by4、选择列4.1dplyr::select4.2 sqldf::select5、创建新的变量5.1 dplyr::mutate5.2 sqld
转载 2023-08-18 14:48:10
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上一篇博客(R中两种常用并行方法——1. parallel)中已经介绍了R中常见的一种并行包:parallel,其有着简单便捷等优势,其实缺点也是非常明显,就是很不稳定。很多时候我们将大量的计算任务挂到服务器上进行运行时,更看重的是其稳定性。这时就要介绍R中的另一个并行利器——snowfall,这也是在平时做模拟时用的最多的一种方法。针对上篇中的简单例子首先是一个最简单的并行的例子,这个例子不需要
转载 2023-11-29 09:55:27
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R的安装R语言的特点就是有众多的第三方扩展,扩展涉及到各行各业的数据分析内容。R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合,包括R程序,运行该程序的其他语言(例如C语言),解释这个程序功能、方法的帮助文档,例子、测试数据等。R自带了一系列默认,包括base、datasets、utils、graDevices、graphics、stats以及methods。这些提供了很多的默
文章目录检查可用R语言1. 获取包含R的库位置2. 获取已安装的所有软件列表3. 获取当前在R环境中加载的所有4. 安装一个新的软件有两种方法安装:5. 加载到当前R环境6. 卸载包包R语言R函数,编译代码和样本数据的集合。 它们存储在R语言环境中名为“library”的目录下。默认情况下,R语言在安装期间安装一组软件。 随后添加更多,当它们用于某些特定目的时。 当我们启
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[更新~] Python网络爬虫与文本数据分析dplyr简介dplyr是R语言的数据分析,很像python中的pandas,能对dataframe类型的数据做很方便的数据处理和分析操作。最初我也很奇怪dplyr这个奇怪的名字,我查到其中一种解释d代表dataframeplyr是英文钳子plier的谐音library(tidyverse)## ── Attaching packages ─────
shiny学习笔记(一)认识shiny第一个例子(01_hello)认识shiny APP的构成用户界面 (ui)服务器功能 (server)shinyApp函数 认识shinyshiny是一个R的软件,它使得直接从R构建交互式web app更加简单。 shiny中有11个例子,可以非常形象直观地解释shiny的工作方式。第一个例子(01_hello)认识shiny APP的构成shiny
 注:以下内容是我个人翻译自Rstudio官网的Shiny教程http://shiny.rstudio.com/articles/basics.html水平有限,敬请谅解在开始之前,先简单介绍一下Shiny框架,以下内容引用于百度百科:‘Shiny是R中的一种Web开发框架,使得R的使用者不必太了解css、js只需要了解一些html的知识就可以快速完成web开发,且shiny集成了bo
转载 2023-10-30 21:34:27
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使用readr进行数据导入导入数据的方法有很多,相信大家也已经有了自己习惯的方法,所以本节的内容只是给大家提供一个选择。所谓技多不压身!本节较多理论性的东西,大家也可以酌情跳过!7.1 简介本章将学习如何将纯文本格式的矩形文件读入 R。虽然本章内容只是数据导入的冰山一角,但其中的原则完全适用于其他类型的数据。本章末尾将提供 一些有用的 R ,以处理其他类型的数据。7.2 入门readr 的多数函
(课程视频链接:https://www.bilibili.com/video/BV19x411X7C6?p=1)1.R语言        R语言是S语言的一种实现。R是一个全面的统计研究平台,提供了各式各样的数据分析技术,拥有顶尖的绘图功能。        R
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