MyEclipse Blue版（蓝色版）是MyEclipse企业开发平台的定制版，专门针对IBM WebSphere应用服务器开发的。作为一个可选的廉价RAD（Rational Application Developer）,此蓝色版包括了很多针对WebSphere的Web服务规范的定制工具和性能优化，并能与ClearCase进行无缝整合，它兼容 WebSphere5.x，6.0和6.1。
目前MyEclipse蓝色版只在windows平台下有效。