黑液蒸发器在长期使用后会结垢，传热管上的结垢是造成黑液蒸发器传热效率下降的主，要原因。积垢普遍存在于蒸发器的黑液一侧，而且在高温、高浓度情况下易结垢，经分析发现污垢中大成分是碳酸钙，主要是木材中的钙与黑液中的碳酸钠反应生成，其他无机垢还包括硫酸盐垢、硅酸盐垢和铁锈垢。硅酸铝垢是由存在于黑液中的硅酸盐与耐火设备衬里中的铝反应生成的。中国造纸厂多用草类原料，草浆中含硅量很高，所以中国黑液污垢以碳酸盐垢及硅酸盐垢为主。黑液结垢中的有机成分有木质素沉淀物，黑液中有机物焦化形成的污垢以及有机酸皂化形成的污垢。

上述各种幸亏垢中，碳酸盐垢可用HCl或HNO₃清洗，当垢层中含有一定量硅酸盐垢时可先用碱洗再用酸洗去除，在酸洗时可加入一定量的HF以提高清洗效率。当垢层中含有相当数量的硫酸盐垢时可采用先碱洗转型后酸洗的方法。其他黑液垢如木质素垢、焦化垢、纤维垢有的溶于水可用水洗去除，有的溶于碱可用碱洗去除，即使水洗、碱洗均不能除去的在酸洗中也会因碳酸钙等水垢的溶解而剥落，所以黑液污垢的去除关键是除水垢。